Вы действительно нарушили закон 2-х государств: украинского, потому что ребенок не получили паспорт в марте, и немецкого, потому что он с марта находится в Германии без действительного документа (Zusicherung никогда и ни в коем случае не заменяет действительный паспорт). Так что это Вы, уважаемая, ничего не понимаете в вопросах ПМЖ, однако лезете на рожон. А Piranja как раз весьма и весьма компетентна, Вам бы послушать, что она говорит.
По поводу того, что же Вам теперь отсылать, Вам надо срочно связываться с украинским консульством и спрашивать у них. Предполагаю, что если Вы отошлете свой паспорт, то они его по ошибке могут аннулировать и Вам не вернуть, тогда и у Вас проблемы начнутся. Может быть, сыну придется какой-нибудь штраф платить за неоформленный вовремя паспорт. Или не надо будет. Точно узнать это Вы сможете только в украинском консульстве.
С немецкой стороной проблем не должно быть, если немцы ничего не узнают о том, что сын находился в Германии без действительного паспорта.