Лично я, уже имея другой паспорт, просто взял в украинском консульстве справку о том, что я состою на постоянном консульском учете и такого-то числа уже сдал документы на выход из гражданства.
После этого спокойно летал на Украину дважды, уже по другому (кипрскому) паспорту, имея в кармане украинский паспорт и ксерокопию этой справки, но они даже ни о чем не спрашиивали.
Сейчас тожно также, в ожидании выписки из указа президента о выходе из украинского гражданства, летает туда моя жена, и тоже никаких проблем.
Есть ещё и третий, тоже проверенный, вариант. Летаешь по украинскому паспорту с отметкой о ПМЖ (постоянном консульском учёте), ксерокопией справки о сдаче документов на выход из гражданства и вложенной в паспорт пластиковой карточкой вида на жительство (если гражданство еще не получено) или же ID той страны, чье гражданство ты уже получил.
Я потихоньку узнал от погранцов, что в связи с кубком УЕФА у них есть разъяснение в конфликты не входить. И если ПМЖ уже оформлен и штамп о постоянном консульском учете в украинском паспорте стоит, то все остальное им фиолетово.