Master Boot Record у нас не привязан к какой-то конкретной файловой системе является самостоятельной структурой независимой вообще от ОС . Там лежит внесистемный загрузчик и таблица разделов . Внесистемный загрузчик как раз и передаёт управление бутлоадеру от операционной системы . Делая fdisk /mbr мы просто приводим его в исходное состояние , убирая ссылку MBR->bootloader .
Бутлоадер ОС может находиться как в первых секторах диска так и в первых секторах отдельных разделов .. Их может быть даже несколько .
Так вот , если в системе стоял Win98 - Win ME то лучше fdiskом .
А если же там до этого жил NTLoader (всё равно , от 2000 или XP ) то придётся его отдельно восстанавливать средсвами самой ОС . Там вроде было что-то типа bootrecovery, в FAQ на 3DNews про это написано ..
А на линукс ты не греши .. Ж8) Он абсолютно точно спрашивал тебя -- устанавливать ли Lilo и если да то в начало диска (сразу же за MBR) или в начальные сектора конкретных линуксовых партиций .. Можно было его вообще не ставить , а грузиться с дискетки ..
И переименовать FS он вряд ли сам смог без твоей помощи , тем более что информация о характеристиках разделов хранится в Partition Table MBR ..
А что за дистрибутив то ?
Кстати подобный эфект по меньшей мере странен , у меня всё вполне корректно вставало поверх XP и последний даже не заметил . Lilo или grub устанавливаю всегда принципиально в MBR ...
--Alt Linux (2.4.12)
WBR,
Schlecht