Во-первых: в дурацкой винде профили хранятся на диске С:
В "дурацкой" винде профили хранятся там, где указано - а это совершенно необязательно диск C:
и если пользователей много и все хранят свои файлы на десктопе, а не в отведенных разделах
Можно чуть-чуть поподробней? "не в отведенных" - это где? С каких порей, вообще, юзверские данные (в т.ч. на десктопе) не попадают в профиль? Нет, ну разумеется, технически это возможно, но автор явно не относится к тому меньшинству, которое хранит профиль где-то ещё.
то диск очень быстро забивается и начинаются реальные тормоза и зависания.
Да ну? Ну-ка, посчитаем, сколько места занимают иконки на десктопе... Ну, допустим, по 1M на юзверя... Допустим, их аж 5 тыс. Имеем - 5G на иконки. Это, безусловно, абсолютно неподъмное значение для современных серверов, правда?
то при входе и выходе пользователя синхронизация может занимать приличное время.
Приличное - это часы? Минуты? Или, всё-же, секунды? И сколько раз средний пользователь входит и выходит из системы в течение дня?
у админа могут быть свои причины всязанные с конфигурацией сети, сервера и т.д., потом скрипты для бекапа и прочее.
Например? Что именно (связанное с иконками и прочими линками на декстопе) может его так сильно напрягать, и почему? Иконки на десктопе и т.п. для него (и скриптов) ничем не отличаются от всех остальных файлов. В чём проблема? Я уже молчу о том, что автор явно говорит об отсутствии у админа объяснения.