Я работал и в НИИ, и в вузе. Ситуация сильно не отличается. Вот приимер: в университете в группе было около 30 человек, 80 компов - включая те, что "висели" на измерительном оборудовании, ни одного мака. Из 30 под линуксом работали трое. Но это химики (точнее - физико-химики, "наноматерьяльщики"). У физиков процент линуксоидов существенно выше. Но вот больше ли у них "маков" - сильно-пресильно сомневаюсь.
Гораздо больше распространен софт, который практически одинаков для любой платформы - например, Matlab, Mathematica, Maple, R, Blender... Если честно, то по моему глубокому убеждению опытному юзеру выбор платформы на данный момент в большинстве случаев глубоко фиолетов. И является либо делом привычки, либо наличием инстрУментов, чрезвычайно подходящих к конкретным задачам. Ну а для "чайников"... С учетом реалий, когда НИКАКИЕ защиты не спасают от вредоносного софта вследствие "человеческого фактора", а "под венду" клепается банально больше средств взлома, то "чайнику" имеет смысл смотреть в сторону мак-ов. При одном условии: "чайник" должен сразу быть готов платить в 1,5-2 раза больше денег совокупно за "железо"+"софт". Конечно, можно порекомендовать линух, во многих случаях это беспроблемный и почти идеальный вариант. Но по моему опыту к линуху нужен/нужны/крайне желательны еще либо линукс-гуру, либо способности к быстрому поиску и усвоению инфы из интернета, ибо любой затык с линухом (а их по моему личному опыту хватает - сразу скажу, что работаю в среде этой ОС около половины всего времени работы за компом) может вызвать ступор и панику. У "чайников" таковые способности мною наблюдалось крайне редко. Плюс, все же есть пара важных областей, где софт есть только "под венду" - например, продвинутые программы для заполнения налоговой декларации - и далеко не всегда такой софт может быть беспроблемно запущен с использованием wine.