В наше время вероятность того что полетит система до полной невозможности восстановления, и то что полетит полностью весь диск, примерно одинакова. (Чем же вас в этом случае спасёт ваше разбиение?)
При современных объёмах данных, места жёсткого диска на лептопе едва ли хватает, чтобы хранить все свои фильмы и музыку. В конце концов приходится хранить данные на внешних носителях (так почему не заняться этим сразу).
В десктопе я бы использовал 2 raid0 массива. Один для системы, другой для данных. Для скорости и безопасности соответственно.
По поводу рикавери.. Есть программки, которые делают кастомный бэкап системы в виде точного зеркала выбранного вами раздела. Есть возможность потом поставить с 0, даже на другой компьютер, со всеми данными и настройками на момент бэкапа. Воостановление простое, загрузка идёт с жёстокого диска, стика или CD, на ваш выбор)
Офигенное наверное чувство, когда после года использования системы и настроек "под себя", приходится ставить чистую, забитую ненужным хламом систему с рикавери)))
Кстати, не бывает корневой секции) Бывают основной и логический разделы). Слова "корневой" и "секция" это из другой оперы.