Вопрос на данный момент пока только о том, почему такое произошло

Потому что что-то пошло не так.

т. е. из-за чего?

Например, из-за усадки здания, недостаточной прочности материалов, погодных условий, перемещения грунта, создания неравномерных нагрузок и т. д.

P. S.

плинтус прикреплен к стене очень крепко (наверное приклеен).

Если так, то плинтусы лучше не трогать.

Потолок наверняка из гипсокартона. Одна из стен тоже из гипсокартона, другая бетонная

Для заполнения трещин и неровностей на поверхности стен и потолков используется шпаклевка. Она может быть на водной или масляной основе. При выборе шпаклевки необходимо учитывать вид поверхности – для штукатурных и гипсокартонных поверхностей подойдет гипсовая шпаклевка, а для бетонных или кирпичных поверхностей лучше использовать цементную шпаклевку.

Можно использовать герметик – это герметизирующий материал, который предотвращает проникновение влаги и воздуха через трещину. Герметик может быть на основе силикона или акрила. При выборе герметика необходимо обратить внимание на его эластичность, чтобы он мог расширяться и сжиматься вместе с поверхностью.