Там и не понял, почему торможение с выжатым сцеплением или на включенной передаче ощутимо увеличивает дрожь. Если тормозить на нейтрали, то дрожь куда меньше.

Попробую.
Сначала уточняющие вопрос: при выжатом сцеплении передача включена?
При торможении на нейтрали сцепление отпущено?

Когда сцепление выжато и передача включена - дрожь максимальная. Когда на нейтрали сцепление отпущено - дрожь минимальная. В любом случае постепенно пропадает, если торможение идёт на скоростях до 50 км/ч и после 100 км/ч.

Думал, может связано с оборотами колёс (и тормозных дисков соответственно) - т.е. если диски кривые, то при сильно высоких оборотах они слишком часто вращаются и не сильно бьют, а при низких оборотах соответственно слишком низкая частота вращения, чтобы сильно бить. Но вот при торможении на 30 км/ч вообще плавно всё, никакого намёка на биение, даже низкочастотное. А при 50-100 км/ч, повторю, биение с частотой в несколько раз больше частоты вращения колёс - т.е. явно не похоже на то, что из-за кривизны тормозных дисков.

И с кривыми тормозными дисками непонятно, с чего им стать кривыми в последние несколько месяцев, как появилась эта дрожь. Диски я перегрел больше полугода назад, и с тех пор нормально ездил. Машина вообще эксплуатируется очень бережно - лишний раз не газую, сильно, педалью до упора, не торможу, в крутые повороты с заносом не захожу, по ухабам или полевым дорогам не езжу. После автохауза, где купил, были поставлены новые тормозные диски и колодки на пробеге 60к, плюс я попросил сделать новый ТЮФ, плюс сделал потом сам Achsenvermessung, полюс поставил новую резину всесезонную. Машина прошла с тех (примерно 1 год) пор всего 7к - чему там ломаться? Один раз воздушный шланг лопнул или погрызен был животным во впускной системе двигателя - заменил. Один раз было небольшое экстренное торможение перед светофором с прошаркиванием колёс где-то на секунду, пару недель назад. А дрожь появилась месяца 3-4 назад. Причём она появилась постепенно - сначала почти незаметно, потом побольше. Но пока вроде до сильной дрожи не доходило. Понятно, что там что-то не то, но насколько, и стоит ли тратить время и деньги на проведение всех процедур, что тут посоветовали - я думаю, нет.