Мы сегодня всем родственникам позвонили, даже в Германию никто не знает где были бабушка с дедушкой во время войны.

Архивная справка, которую Вы выложили, свидетельствует о том, что семья дедушки с бабушкой была за пределами СССР, т.к. директива, указанная в справке, относилась ТОЛЬКО к репатриированным немцам, а если еще учесть, что они проживали до войны на оккупированной в последствии Гитлером территории, то 2+2=4. Вероятней всего, они были сначала вывезены в Германию с отступающими немецкими войсками, а потом, после окончания войны, возвращены в СССР (репатриированы), прошли фильтрационный лагерь и были направлены на спецпоселение. Велика вероятность, что во время пребывания в Гермнании, семья получила гражданство. Очень странно, что никто об этом не подумал, в том числе и адвокат, который вел дело, когда Ваш свекр пытался остаться в Германии.

Запросить СОР или актовые записи бабушки и дедушки мужа

Если им было более 16 лет в июне 1941-го (а им было больше, судя по справке один точно был 1914 года рождения), то сведения об их рождении не нужны.

Вот Бундерсархив как это делается тоже не понятно

Зарегистрируйтесь в ветке Забытые внуки Германии, там Вам все подскажут.

А как вообще доказывают декларацию прорадителей на 1941 год тоже не понятно.

В идеале справками о репрессиях по национальному признаку, т.к. репрессии начались аккурат в 1941-м году, после начала войны или первичными документами с декларацией предков, например СОР, СОБ, полученными в период с 1941 по 1955. Но если у предков было гражданство Германии, то это тоже подойдет.