По маме (мамы) СОР не сохранился, поэтому связи прямой с дедом явно не видно.

Вы пытались его найти? Куда делали запрос?

В мамином СОРе у ее мамы прочерк - не потому что та так хотела, а потому что чиновники не стали указывать.

И что значит "чиновники не стали указывать"? Не захотели указывать только в СОР? А в актовых записях, что указано? В 1948-м году национальности родителей должны быть указаны в актовых записях.

Но связь деда с мамой можно увидеть в похозяйственной книги.

В BVA просто не захотели разобраться с документами

Похозяйственная книга не является документом, подтверждающим кровное родство (происхождение). С прадедом могли проживать и усыновленные дети и дети супруги от предыдущих браков. Нужно СОР бабушки или архивная справка о рождении. BVA отказываются принимать похозяйственную книгу и в качестве декларации, потому что информация в ней могла быть указана со слов, а не на основании документов. Они хотят видеть СОРы детей или паспорт прадеда или справки, подтверждающие репрессии по национальному признаку. Вы пытались выяснить подвергался ли прадед таким репрессиям?

и список немцев-меннонитов призывного возраста, где он также фигурирует.

Какими годом датирован этот документ? И что это за список немцев-меннонитов? Куда призвали прадеда? В 1942 прадеда еще вполне могли мобилизовать в трудовую армию, возраст мужчин был ограничен 55 годами. Сначала 50-тью (февраль 1942-го), но в октябре 1942 его увеличили до 55-ти лет.