ИМАХО.

Все зависит от того, на сколько вы хотите усугубить конфликт.
Конфликт уже есть, и ваш начальник напрямую этому сопутствует. Чего только одна его фраза стоит: "Он взял время подумать, оставаться ли ему в проекте, ибо последнее время ему некомфортно в коллективе!" Данный выпад не предполагает никаких путей решения. К чему он вообще это сказал? Почему он, собственно говоря, требует поиска решений сложившийся ситуации именно от вас. Если 3 работника не могут разрулить проблемы, то ее помогать должен был как раз он. Очень непрофессионально его стороны.

Ладно, шефа вам не изменить.

Рассмотрим мирный путь. Делаете на пару с быстрым коллегой как можно больше, пока медленный не вернется из отпуска. По возвращению медленного из отпуска, назначаете с ним и быстрым термин. Кратко описываете, что успели сделать в его отсутствие. Более подробно следующие шаги. Говорите, что после выхода из отпуска вы понимаете, что у него много дел и готовы его поддержать на всех планерках. Спрашиваете, как он себе в будущем видит коммуникацию, чтобы его частично разгрузить. Например, вы сами пишете отчеты продукт менеджеру, с копией медленного. Или каждый день 10 мин планерку, где обсуждаете проблемы. В общем, основная стратегия для вас - понять, как вы можете помочь медленному успеть сдать тех часть проекта в срок. При этом вы должны донести до медленного ваше желание помочь и ему, и проекту.

Теперь конфликтный путь. После выхода медленного из отпуска, созываете совещание с ним, продукт менеджером и начальником отдела. Где рассказываете, что вы успели сделать, пока медленный был в отпуске. Фокус на том, как много всего вы успели переделать. Предлагаете свой путь решения всех тех проблем для достижения единственной цели - закрытие проекта в сроки. Здесь есть и ваши риски, не забывайте. Предлагаете пути коммуникации. Вы отправляете емайлы медленному с вопросом и вашим путем решения с копией начальнику отдела и продукт менеджеру. В емайле указываете срок принятия решения. Добавляете, что если ответ на емайл не поступил, то вы воспринимаете это, как согласие с вашим решением. Уточняете на собрании, все ли согласны с такой коммуникацией. Если нет, то пусть предлагают свои варианты. В данном случае ваша стратегия - это показать продукт менеджеру и начальнику отдела, как много вы успели за короткий срок отсутствия медлительного. Так же, что для вас самое важное - это сдать проект в срок, и вы готовы взять ответственность за тех. решения на себя.

Есть много решений между двумя вышеперечисленными крайностями. Выбирать вам.