На данный момент есть венгерская виза. По высказыванию сотрудников венгерского посольства, в страны шенгена по ней ехать нельзя, т.к. отркрывали ее до того, как Венгрия вошла в шенген. Шенгенскую венгерскую могут поставить только по истечению действующей. Она заканчивается в феврале. Если в феврале сделать венгерскую шенгенскую визу на пол года и одновременно подавать документы на немецкую визу на учебу, не будет ли проблем в немецком посольстве? Или они по открытию немецкой венгерскую анулируют? Ведь пишут на форуме, что нельзя иметь одновременно 2 шенгенские визы, действующие на разные страны.

Возможно анулируют.

Две шенгенские визы иметь нельзя, но если Вы будете "подавать документы на немецкую визу на учебу" и Ваше хотдатайство будет удовлетворено, то Вам выдадут не шенгенкую, а немецкую национальную визу. Поэтому двух шенгенских виз у Вас не будет. К слову если бы Вы запрашивали немецкую шенгенскую визу, то венгерскую Вам необходимо было бы самостоятельно аннулировать в венгерском посольстве.