Вопрос:
Самолёты пока в Германию летают. В принципе можно попытаться пройти на рейс, предъявив в Англии карточку немецкого ПМЖ, так как она "годна" ещё несколько лет. В Германии на границе, я думаю, тоже может прокатить, если погранцы не будут усиленно пытать. Предположим, прокатило, въехала.

А что делать здесь, как переждать, пока всё нормализуется? Предположим, учёба нормально начнётся в Сентябре. До Сентября больше 90 дней, надо в АБХ просить какое-то разрешение на пребывание, типа национальной визы или ещё что-то.

Предположим, прокатило и въехала. Если она изучает не что-то редкое и уникальное (а-ля медицина), то можно поступить след. образом: находите знакомого у кого бизнес и просите его согласиться взять её к себе на неоплачиваемую стажировку/практику на 90 дней (если она влетит в середине апреля - это будет до середины июля). Собственно, от него требуется лишь подмахнуть бумажку - но для неё это становится поездкой - как бы - связанной с её учёбой. Ближе к концу этого срока она обращается в АВН, мол, в связи с производственной необходимостью (предположим, преддипломная практика это для неё и ей важно завершить проект) прошу разрешить задержаться на 6 недель (аккурат до начала сентября). В этом случае ей в АВН на руки выдадут предписание покинуть страну - и поставят там этот срок. Аргументировать можно будет не только продлением стажировки, но и сложностями с возвращением в Англию / Израиль.