Будут ли какие-нибудь препядствия для выезда, если человек работает на закрытом (секретном) заводе? Подскажите пожалуйста.

Работает в какой стране? В стране выезда? Тогда надо искать ответ в законодательстве именно этой страны. Поэтому для получения более точной информации сообщите, из какой страны вы намерены выехать, ведь законодательства стран СНГ (я думаю, что вы собираетесь выехать из одной из этих стран) несколько различаются между собой.
Dok studente tris rublius
Ir mergele tavo bus

Мой брат работает на закрытом (секретном) военном заводе и чтобы туда устроится он ждал допуск из Москвы. Тоесть его проверяли на "профпригодность" несколько месяцев. Живу я в России.

Если у него уже есть загранпаспорт - сначит может ехать .
На контроле ловить не будут . Если нет - будут трудности с получением паспорта в ОВИРЕ .

А выезжать брат будет? Загранпаспорт у него есть? Если нет, то по какой форме ему оформляли допуск? Если по 1, то могут быть проблемы (раньше такие люди после увольнения были еще 15 лет невыездными, сейчас точно сказать не могу, но ОВИР даст более конкретный ответ).
Только ногами не бейте - я щекотки боюсь

В настоящее время, так называемые бывшие "невыездные" отданы полностью на растерзание своему бывшему руководству Т.е. как только у вас возникает желание оформить загранпаспорт, первым делом идет письмо в то место, где вы работали, в отдел кадров..если они там "дают добро" то проблем с получением паспорта быть не должно, единственно эта процедура может затянуться на пол года Знакомый работал в ГРУ, точно не помню, но допуск имел то ли нулевой, то ли первый..получил загранпаспорт спустя 7 месяцев после подачи анкет

моему племяннику не дали поехать программистом в США. сказали,
увольняйся и через 10 лет поедешь. Но есть люди-решают проблемы7