Хотел уже сказать что, скорее неправы, но...
Я раньше, когда цитировал ╖9a Abs. 3 Nr. 5 не до конца его привел, полностью он звучит так:

После 01.05.2005 у вас прошло 2 года в которые "die eheliche Lebensgemeinschaft seit mindestens zwei Jahren rechtmäßig im Bundesgebiet bestanden hat". И по ╖31 Abs. 1 вы вроде бы получаете "eigenständiges Aufenthaltsrecht", но... Дальше в этом же 1-м абзаце написано (Satz 2):

Имея 16й параграф на NE или DA-EG подавать нельзя. Т.е. получается что и в то время, пока у вашего мужа был AE по ╖16 вам (по немецким законам) в срок пребывания не зачтут.
А вот с 01.10.2006, как только у мужа стал AE по ╖18, время в зачет пошло, вы больше под ╖9a Abs. 2 Nr 5c не попадаете.

согласен, ситуация здесь немнпго зыбкая... с одной стороны можно аргументировать тем, что случай супругов студентов в RL 2003/109/EG не рассмотрен и вряд ли разумно предполагать, что их пребывание было более временным, чем пребывание самих студентов (из чего видимо исходят некоторые ABH, засчитывая вполовину пребывание и супругам). с другой стороны не очевидно, что цитируемый Вами Satz 2 утверждает, что "супружеский стаж" периода, когда иностранец имел "временный" (непродлеваемый) ВНЖ не засчитывается и после того, как иностранец сменил его на "нормальный".
я не исключаю, что притязание на "самостоятельный" ВНЖ может появиться сразу после смены статуса супруга с "временного" на "постоянный", если перед этим "супружеский стаж" на территории Германии продолжался более двух лет. такого мнения придерживались многие комментаторы даже в период AusLG (зачет супружеской ABW или ABF). еще один (несколько более слабый) аргумент: до 28.08.2007 процитированный Вами Satz 2 в § 31 отсутствовал, и следовательно в рассматриваемый период (1.1.2005-1.10.2006) время таки шло в зачет двухлетнего срока. если бы автор тогда обратилась за неограниченным разрешением на трудовую деятельность по § 29 Abs. 5 AufenthG, такой аргумент был бы неоспоримым...

В принципе да, нелогично что жен считают по другому, чем самих студентов...

Так с этим и я не спорю. Если я ничего не упускаю из вида, из ╖31 Abs. 1 явно следует что супружеский стаж на территории Германии считается всегда (ограничений и пояснений что же засчитывается в этот 2-х летний срок нет), но право на самостоятельный ВНЖ появляется как только у супруга появляется ВНЖ дающий право на получение NE или DA-EG.
Но ведь это все равно ничего не дает, разве не так?. Да, после 01.10.2006 автор получила право на независимый ВНЖ. Но с этого же момента она и так перестала попадать под ограничение описанное в ╖9a Abs. 3 Nr. 5(c). По состоянию до 01.10.2006 они под это ограничение попадала, так как у супруга ВНЖ для "временной цели" и независимый ВНЖ получить она не могла.
А нет ли шансов пробовать доказать что после всех облегчений студентам, закончившим ВУЗ в Германии, ВНЖ для учебы это уже не ВНЖ для "временной цели"? Ведь с 1.1.2005 после учебы можно получить ВНЖ на поиск работы и (с какого числа? с 1.1.2009?) без проверки рынка труда получить ВНЖ по ╖18.

Опять соглашусь с Вашими выводами. Но по-ходу хочу задать вопрос. Вот Вы пишите:
"Т.е. получается что и в то время, пока у вашего мужа был AE по ╖16 вам (по немецким законам) в срок пребывания не зачтут. А вот с 01.10.2006, как только у мужа стал AE по ╖18, время в зачет пошло, вы больше под ╖9a Abs. 2 Nr 5c не попадаете."
Да все так, но ведь не муж подает на DA-EG, а я хочу подать. А у меня с 01.01.2005 по 31.07.2007 был АЕ по ╖30. Или это не имеет значения для ABH и важен только ╖ супруга?

мой пойнт был как раз в том, что тогда она его получить могла. пкм по букве закона, учитывая отсутствие в то время Satz 2...

это - тоже интересный момент. в любом случае разумно подать заявление, а уже потом - в случае отказа - изучать его обоснование...

повторю свой предыдущий совет... дополню его предложением, чтобы на DA-EG уже сейчас подал Ваш муж. пкм по срокам он проходит...

да нет не выходит. с 01.05.2003 по 30.09.2006 как студент по ABW+AE ╖16. т.е. 41/2=20.5 месяцев. затем 01.10.2006 по 31.07.2007 как научный сотрудник по AE ╖18, т.е. 10 месяцев. Затем с 01.08.2007 по 31.01.2009 как мой супруг по AE ╖30, т.е. 18 месяцев. Итого: 20.5+10+18=48.5 месяцев.