Люди, простите за странный вопрос, но кто подскажет, как в программке на С с правами пользователя "сделать" Logout из ICEWM; из которого эта программка и была запущена?

наверное никак, icewm не умеет IPC, можно сорцы самого wm-а поправить, слушать какой-нибудь порт и делать перелогин например.