Делайте, как считаете нужным. Заплатите гутахтеру 500-700 евро и Вас сместе с гутахтером Ваш застройщик пошлёт подальше. Потом ещё и адвокату придётся отстёгивать. Там ремонта на 100 евро, 10 картуш силикона.

Мнение застройщика должно быть подкреплено ссылкой на действующие нормы в строительстве, где допуски выражены в цифрах. В вашем случае всё похоже на некачественные работы по уплотнению грунта под фундаментом или под бетонным полом, при этом происходит значительная просадка в первые годы эксплуатации.