Deutsch
Germany.ruФорумы → Архив Досок→ Здоровье

Коронавирус. Памятка

bradipina коренной житель04.05.20 09:42
NEW 04.05.20 09:42 
в ответ vitminc 04.05.20 07:11, Последний раз изменено 04.05.20 09:50 (bradipina)

В Америке не такое же население, как в Германии. Там не 81 миллион, а 328.

да, в графике Америки, как я и предполагала, видно, что эффективное число может быть выше среднебазового (4,5 вместо 3,5, возможно выше, если смотреть только НЙ), что объясняет взрывное развитие; в Италии и Испании (и Лондоне) подозреваю тоже.


Про Германию



ну вот как пример на вашей облегченной версии:

более короткий заразный период, на порядок меньшее число инфицированных в начале, реальное эффективное число репродукции при интервенциях, фактор 170, 34% инфицированных (скорее всего можно манипулируя дальше получить любой другой результат)


к тому же учитывая, что 34% (или даже 40%) среднее, во многих землях, где эпидемия началась позже и по сути уже во время карантина может быть и 10% и 15%


vitminc старожил04.05.20 09:55
vitminc
NEW 04.05.20 09:55 
в ответ bradipina 04.05.20 09:42, Последний раз изменено 04.05.20 10:03 (vitminc)
В Америке не такое же население, как в Германии. Там не 81 миллион, а 328.

Спасибо, что проверяете. Я действительно очень невнимателен. Вопрос на самом деле в одном. Есть ли смысл в том, что получилось вытащить или нет?

Думаю, что с облегченной версией можно сделать все быстрее, проверив другие страны или регионы. Важно понять верна ли оценка заболевших. Пока нет действительно качественных серологических тестов просто не на что опереться.


Отдельное спасибо за помощь в коррекции текстов.


Скорректированные данные для США.



ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
Некто2 гость04.05.20 10:08
NEW 04.05.20 10:08 
в ответ vitminc 04.05.20 09:32

Все не зря, а в споре рождается истина. Даже если Ваши выкладки неверны, они могут дать направление Вам же, или Вашим коллегам для новых, более точных расчетов. А нам это даёт надежду на то, что решение будет найдено.
спасибо Вам большое за Ваш труд!

bradipina коренной житель04.05.20 10:17
NEW 04.05.20 10:17 
в ответ vitminc 04.05.20 09:55, Последний раз изменено 04.05.20 10:28 (bradipina)

повторюсь, нужна картинка отдельно Нью Йорк и отдельно все остальное чтобы проверить, но я думаю, модель не работает: половина случаев в США в НЙ+НДж+Масс. то есть если среднее почти 50%, то там должно быть в среднем почти 100 (96%), при базовом числе репродукции для затухания нужно 75%, так что рост должен был остановиться уже пару недель как, а он не остановился


к тому же мне кажется очевидным, что кривая наверху вовсе не так загибается, как красная расчетная, там намного дальше от насыщения.


ну и точки интервенции и их значения вызывают вопросы.

vitminc старожил04.05.20 10:19
vitminc
NEW 04.05.20 10:19 
в ответ bradipina 04.05.20 10:17, Последний раз изменено 04.05.20 10:21 (vitminc)

Я сделаю для NY нужно количество людей в штате и данные в формате csv по дням. В вашей ссылке только итоговые значения.

ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
2Dublin свой человек04.05.20 10:31
NEW 04.05.20 10:31 
в ответ vitminc 04.05.20 10:19

https://covidtracking.com/api/v1/states/daily.csv

но эти данные по положительным тестам, они немного отличаются от worldometra и cdc

bradipina коренной житель04.05.20 10:31
NEW 04.05.20 10:31 
в ответ vitminc 04.05.20 10:19, Последний раз изменено 04.05.20 10:49 (bradipina)

https://github.com/nychealth/coronavirus-data/blob/master/case-hosp-death.csv

это город

в городе 8.4 миллионa

как и всегда, брать можно до 4-5 дней назад (30.4., дальше данные неполные)

отдельные штаты можно брать с worldometer

Honeymami завсегдатай04.05.20 10:34
NEW 04.05.20 10:34 
в ответ vitminc 04.05.20 10:19, Последний раз изменено 04.05.20 10:48 (Honeymami)

Может, лучше NYC, есть серология для города от Куомо на 23. апреля 21.2 % иммунных.


https://www.nbcnewyork.com/news/local/new-york-virus-deaths-top-15k-cuomo-expected-to-detail-plan-to-fight-nursing-home-outbreaks/2386556/


здесь данные NYC


нужно смотреть Daily counts: в диаграмме Cases кликать по дням, тогда появляется число инфицированных по дням (интерактивная диаграмма)

https://www1.nyc.gov/site/doh/covid/covid-19-data.page

bradipina коренной житель04.05.20 10:48
NEW 04.05.20 10:48 
в ответ Honeymami 04.05.20 10:34, Последний раз изменено 04.05.20 10:50 (bradipina)

по NYC я дала выше csv

vitminc старожил04.05.20 10:49
vitminc
NEW 04.05.20 10:49 
в ответ bradipina 04.05.20 10:31

NYC

Давайте думать. Сам файл я прикрепил


ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
bradipina коренной житель04.05.20 10:53
NEW 04.05.20 10:53 
в ответ vitminc 04.05.20 10:49, Последний раз изменено 04.05.20 10:54 (bradipina)

в то, что в НЙ 40% я даже готова поверить (ок по тестам 20%, но погрешностъ в 2 раза я переварю пока)

и даже в фактор 1:20, там много тестируют

проблема в том, что если в НЙ 40% то по США никак не могут быть те же 40%, в среднем максимум 20% (максимум!)

ваша модель на реальных многофакторных данных не работает, увы


можно попробовать посмотреть в Германии отдельно каждую землю, каждый город, будет много чудных открытиj

Honeymami завсегдатай04.05.20 10:55
NEW 04.05.20 10:55 
в ответ vitminc 04.05.20 10:49, Последний раз изменено 04.05.20 10:58 (Honeymami)

Могу только предположить, что слишком рано они тестировали. Нужно выждать 20 дней после начала инфекции:


https://www.labor-passau.de/aktuelles/detail/getarticle/News/detail/igg-antikoerpertest-auf-sars-cov-2/


это кстати были хорошие новости по нашим новым тестам. У них очень высокие параметры чувствительности и специфичности.


какие тесты были в NYC,неизвестно

vitminc старожил04.05.20 10:56
vitminc
NEW 04.05.20 10:56 
в ответ vitminc 04.05.20 10:49, Последний раз изменено 04.05.20 10:56 (vitminc)

Могу предположить, что считаем по детектируемым и переносим на всех заболевших с неправильной пропорцией.

Т.е. модель работает, но оценку по переболевшим по ней делать нельзя.

ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
bradipina коренной житель04.05.20 10:59
NEW 04.05.20 10:59 
в ответ vitminc 04.05.20 10:56

если нельзя делать оценку по переболевшим - в чем прогностическая ценность?

vitminc старожил04.05.20 11:00
vitminc
NEW 04.05.20 11:00 
в ответ bradipina 04.05.20 10:59
если нельзя делать оценку по переболевшим - в чем прогностическая ценность?

Можно как минимум сделать прогноз по новым случаям и необходимым ресурсам для их сопровождения.

ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
bradipina коренной житель04.05.20 11:08
NEW 04.05.20 11:08 
в ответ Honeymami 04.05.20 10:55, Последний раз изменено 04.05.20 11:15 (bradipina)

при времени удвоения 2 недели назад в 7 дней (не проверяла, но возможно), 20% 23.4. могут вполне соответствовать 40% на 30.4.,

посмотрела на график: на 23.4. по графику 35%. но все равно, в половину ложноотрицательных можно поверить при желании. (хоть и не обязательно, там могло быть наоборот много ложноположительных из-за перекрестных реакций).


просто модель если и работает, то разве что только, как я уже и предполагала (я писала тут, и потом видела комментарий на хабре) в идеальной гомогенной системе, где все распространяют, болеют и тестируются одинаково.


но да, прогноз по случаям это тоже хорошо - это то, чем мы тут всю ветку с vitminc + samowar и занимаемся с большим удовольствием.

vitminc старожил04.05.20 11:16
vitminc
NEW 04.05.20 11:16 
в ответ bradipina 04.05.20 11:08, Последний раз изменено 04.05.20 11:18 (vitminc)
идеальной гомогенной системе, где все распространяют, болеют и тестируются одинаково

Да, похоже очень точное определение.


P.Real.Infected = количество позитивных / размер популяции x Ratio.Detected


Мозги уже не работают, что это в реальности за величина получилась? Как ее интерпретировать? Какой смысл несет Ratio.Detected если только с этой коррекцией кривые совпадают?

Еще раз спасибо. Написать то я 2 дня назад написал, только умственная усталость уже сказывается.


ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
Honeymami завсегдатай04.05.20 11:19
NEW 04.05.20 11:19 
в ответ vitminc 04.05.20 10:56

нужно сравнивать постепенно с серологией по городам.


вот статистическое обоснование по Хайнсбергу:


https://www.researchgate.net/profile/Roland_Prof_Dr_Jeske/publication/340583332_Statistische_Analyse_der_Heinsberg_Studie/links/5e92e0f192851c2f52989ae5/Statistische-Analyse-der-Heinsberg-Studie.pdf?origin=publication_detail

vitminc старожил04.05.20 11:22
vitminc
NEW 04.05.20 11:22 
в ответ vitminc 04.05.20 11:16, Последний раз изменено 04.05.20 11:28 (vitminc)

В общем я попытался. По крайней мере совесть чиста.


Aus Sicherheitsgründen können wir E-Mail-Anhänge und externe Links nicht öffnen. Externe Quellen können wir zudem kapazitätsbedingt nicht kommentieren.

Informationen zum Coronavirus SARS-CoV-2 sind auf der Internetseite des RKI abrufbar unter www.rki.de/covid-19 , unter anderem die Risikoeinschätzung des RKI sowie die Antworten auf häufig gestellte Fragen (FAQ). Diese Informationen können sich aufgrund neuer Erkenntnisse kurzfristig ändern. Das RKI verfolgt das Geschehen kontinuierlich und steht mit der WHO in Kontakt.

Auch die Bundeszentrale für gesundheitliche Aufklärung (BZgA) hat auf ihrer Internetseite Informationen zum Coronavirus SARS-CoV-2 veröffentlicht: https://www.infektionsschutz.de/coronavirus-2019-ncov.html.

Freundliche Grüße aus dem Robert Koch-Institut.

ɐwʎ ɔ vǝmоɔ dиw
Olgochka патриот04.05.20 11:23
Olgochka
04.05.20 11:23 
в ответ bradipina 04.05.20 11:08

НП

Можно вопрос от человека, который вообще ничегошеньки не понимает в ваших выкладках, расчетах и графиках.

Не проще бы было взять за модель для расчетов не таких гигантов как США и Германию, а попробовать вывести формулы на более обозримых государствах, например, тех же Балтийских государствах? В Эстонии 1,5 миллиона жителей, 1700 случаев и 55 смертей. 3 мая один заразившийся, при этом нет обязаловки носить маски, сады не закрывали, на улицу можно было выходить как и у нас.