уложиться вам надо в течении срока нахождения в Германии, а это как я понимаю максимально 3 месяца
а учитывая то что проверка через земельный суд длится в среднем 3-4 месяца - это маловероятно (но бывает получается)

так я вернусь в чехию и буду там ждать, или так нельзя?

я не поняла у вас виза или ВНЖ? если ВНЖ то - вполне можете (если разве что ЗАГС не заартачится принимать документы, что тоже бывает), если виза то 3 месяца распостраняются на все шенгенское содружество, т.е. см. выше.
если у вас виза, то при выезде назад в Чехию вы автоматически теряете хоть и шаткий, но присутствующий шанс получить ВНЖ без процесса воссоединения.

ок, поняла, спасибо...
Тогда вот такой вопрос, а могу я подавать документы на немецкую визу невесты прям в чехии или германии? потому что я не могу ездить туда-сюда из чехии в россию

подавать документы вы должны по месту вашего фактического проживания (не всегда идентично с местом прописки). в Германии вы это делать не можете ни при каких условиях, в Чехии - зависит от того, что вы там делаете.

я учусь в чехии, у меня и временная прописка в паспорте, уже около года тут. Тогда я имею право?

т.е. у вас чешский ВНЖ?
судя по формулировке московского консульства:

- да. но что-то я не вижу на сайте чешского консульства возможности воссоединения. самый точный ответ вам даст посольство Германии в Чехии, сделайте просто запрос по мылу.

спасибо огромное! что-то я об этом не подумала)

Я подавала в Праге в немецком посольстве. Никто меня в Москву не прогонял.

вот и здорово! :) спасибо!