Делаю Anerkennung моего диплома, не хватает одного документа- подтверждение преддипломной практики.

Как лучше всего сделать запрос в учебное заведение в России, чтобы получить в Германии? Написать им на Email, обычным письмом с росписью или позвонить?

Странно, что у Вас требуют это. Информация касательно всех практик находится в выписке из зачетной ведомости. Выписку из зачетной ведомости же выдают вместе с самим дипломом.

Позвоните для начала в деканат, наведите мосты, и спросите, что им нужно от Вас, чтобы документ запросить.