У вас в голове каша манная консистенции уровня "дети на полдник в детском садике не хотят"

Хотя проверку конечно же делали и было всё ок.

Если паспорт прошел проверку МВД и все было ОК, то это означает, что вы обладали действительным внутренним паспортом.

Может быть это из-за отсутствия внутреннего паспорта, который давно истёк, точно не известно.

Так он все таки отсутствует или срок действия внутреннего паспорта истек? У отсутствующего паспорта нет свойства "действителен/срок действия истек".

Если паспорт ранее присутствовал, а теперь отсутствует, то это означает, что вы вышли из Гражданства РФ и сдали паспорт.

Если вы прозевали срок истечения паспорта (45 лет), то это ваше личная проблема. На предпоследней странице паспорта про это написано.

Но из полезностей для меня оказалось только идентификация через ГУ в СФР.

А теперь проверьте, сможете ли вы авторизоваться в https://es.pfrf.ru/ используя учетную запись в Единой системе идентификации и аутентификации (ЕСИА), в которой лежат данные вашего наверняка просроченного паспорта. И сможете ли вы получить там какой-нибудь отчет или справку.