Вам нужно обращаться не в консульство, а в собес по месту, где был прописан Ваш отец.

Сомневаюсь, что сестра сможет получить пенсию отца за все три года, поскольку, живущим за границей пенсионерам РФ, необходимо каждый год представлять в собес, такназываемую, справку о нахождении в живых по состоянию на 31.12. Что, судя из Вашего поста - не делалось.
Но некоторые пенсионеры умудряются получать пенсию не предоставляя этой справки. Просто их доверенные лица предоставляют в собес паспорт пенсионера. Но это можно сделать, когда в собесе не знают, что пенсионвр выехал на ПМЖ.
Таким образом, Ваша сенстра может получить пенсию отца только за тот год, в котором отец предоставлял в собес вышеназванную справку, и только при усливии, что с момента подачи справки не прошло три года, а если прошло, то при условии, что собес добросовестно перечислял эти деньги на счет пенсионера. Есть еще варианты, но информации предоставленной Вами для этого не достаточно.
http://www.rechtsberater-cccp.de