Имею возможность поработать от нем. фирмы в Москве, имею русское и нем. гражданство, нужно ли сняться с учета в Российском посольстве в Германии и иметь на это время прописку здесь? Помогите советом, заранее благодарна.

Какой срок? Вообще не нужно сниматься.

срок до 5 лет, а как получить внутренний паспорт и прописаться?

срок до 5 лет, а как получить внутренний паспорт и прописаться?
Есть 2 варианта:
1. Вы остаетесь на консульском учете, а в России делаете регистрацию по месту временного пребывания (хоть 5 лет можете так жить, закон разрешает). При этом, так как вы считаетесь временно пребывающей на территории РФ, то основным документом, удостоверяющим вашу личность будет являться загранпаспорт, хотя внутренний вы тоже можете получить по вашему желанию.
2. Вы снимаетесь с консульского учета и в России делаете регистрацию по месту жительства (вы ее называете пропиской). В этом случае вам в обязательном порядке придется получать внутренний паспорт.

спасибо большое за инфо, можно ли будет по истечении 5 лет снова встатъ на конс. учет в германии?

можно ли будет по истечении 5 лет снова встатъ на конс. учет в германии?
да.