У меня в рос. визе в немецком паспорте стоит однократный въезд. Можно ли поменять на двукратный, если я уже нахожусь в Питере и где это можно сделать?

Визовыми вопросами, в том числе вопросами продления виз, занимаются УФМС.
Вот в Питере http://www.ufms.spb.ru/
Соответственно только там Вам и могу ответить.