Возможно почему-то не проапгрейдился вместе с версией Thunderbird?...
Они при обновлениях довольно часто - навскидку раз в 2-3 месяца - меняют "версию" профайла (не знаю, какие именно файлы, возможно как-раз prefs.js?).
У меня Thunderbird установлен и на работе, и дома, а profile с существенным архивом почты живет на внешнем SSD.
Я поначалу был в восторге - какое удобное решение, чтобы иметь дома и на работе строго синхронный архив почты с быстрым поиском по нему.
Потом вылезли грабли, что если Thunderbird автоматически проапгрейдился и поменял версию профайла - более старый Thunderbird на другом компьютере отказывается с ним запускаться. И не апгрейдится, поскольку ему для этого необходим профайл, с которым он умеет работать.
Приходится создавать новый, пустой, апгрейдить с ним и потом снова подсовывать свой "рабочий" профайл.

Но последний раз эта фигня была с месяц назад, с середины октября точно не было. Thunderbird 78.4.0