загризусьс дискаи зайди в репаратур и сотри вторую винду потом тока надо будет фаил boot.ini отредоктировать и усе

Первый вариант не понял.
Второй хочу попробовать, как поступать после форматирования диска, ведь винда захочет дальше продолжить установку, не ужели просто отключить комп?
3-й уже только что скачал, посмотрим что эта утилитка сможет.

boot.ini например, MBR также только на одном из хардов будет. Но у него при уст 2й ОС первый хард был вообще отключен :)

Если через консоль восстановления то не захочет. Не путать с установкой. Но учитывая что "Я вообще то в DOS не разбираюсь" то я бы посоветовал выбрать способ с графическим интерфейсом :) ЛайвСД, Акронис, Партишн Мэйджик...

Я думаю, можно еще скачать Paragon Rettungs-CD Demo, записать его на диск (лучше на RW, так как все равно демо), и потом с этого диска загрузиться. Думаю, что форматирование в демо-версии не отключено.
Посмотрите, попробуйте, что удобнее и понятнее. Paragon тут -> http://download.paragon-software.com/demo/pmpro_recovery_demo.exe

не на всех пиратках есть консоль востоновления.

после формата в режиме установки начинают файлы на жёсткий копироваться так что можеш отключать если сидишник не жалко или подождать до ребута а потом из рабочей винды эти временые файлы удалиш а если с рабочей виндой диск отключиш то и boot.ini не надо редактировать будет
на счёт файла подкачки смотри чтоб был на с

А как же раньше оба винта работали вместе с одной ОС? А хард совсем не обязательно отключать, можно и в биос настроить с какого хочешь запускаться. Только джмпера надо на хардах ставить не мастер- слэйф (master - slave), а Cable select.
И я вообще не могу понять, почему не форматирется весь раздел на втором харде, если система записывалась на первый хард в отсутствие второго!
Он весь должен форматнутся, если только грязь какая не залегла туда, которая запускается под первой ОС. Попробуй подключить проблемный хард у соседа , или у друга, и там его форматнуть!

Зачем эти костыли с демо версиями ???
Есть прекрасный свободный ливСиДи с gparted , весит всего 27мб, свободно доступен для скачивания
набрать в гугле Gparted Live CD
зайти на сайт проэкта
скачать образ
... записать образ на диск загрузится и отформатировать все что нужно.
Автору уже советовали, но он пытается сделать всё через джопу. Ну что ж ССЗБ

Чего то из всей дискуссии у меня какой-то большой глюк в голове. А если второй диск указан при установке какой-то проги и эта прога в данный момент активна? Вот и не пускает. Закрыть все ненужные программы, остановить все ненужные процессы, потом в Datenträgerverwaltung сначала стересть все logische Laufwerke а уж потом прямо оттуда и форматнуть. В чем проблема не въеду.