За поставленный товар из России Гмбх должен заплатить российскому ООО 1000 евро. Должен ли Гмбх заплатить ещё мервертсштоер при оплате этого растаможенного российского товара?

Должен ли Гмбх заплатить ещё мервертсштоер при оплате этого растаможенного

у вас немного бардак в голове.

НДС платится местной налоговой (подозреваю, в данном случае, немецкой), неважно откуда ввозится. под это у ГМБХ есть регистрационный номер (VAT ID, MwSt ID и т.п.)

на самом ли деле деньги туда идут, зависит от огромного количества разных факторов.

так, но немножечко не так.

При растаможке импортируемого товара получатель товара уплачивает в бюджет ФРГ ввозной НДС по ставке ФРГ. Оплата делается в таможню напрямую без указания налогового номера плательщика. .

Если же ТС имеет в виду, должен ли он, покупая товар из РФ на вывоз из уплачивать русский НДС русской фирме сверх упомянутых 1000 евро, то \это зависит от законодательства РФ. Обычно экспортируемый товар НДС не облагается, а как в РФ - бог его знает, страна ведь с особым путем...

Груз из страны не выйдет без экспортной (можно конечно, но мало смысла и дорого). А при экспортной, инвойс будет с 0 НДС. Там пляски с оформлением будут, это да.
А как таможня ФРГ контролирует кто ей деньги прислал и за что? В платёжке банковской указывается номер налогоплательщика?

таможня выписывает платежное требование и присваивет делу свой собственный номер. Этот номер указывается а платежке. Или в квитанции об оплате наличными прямо на таможне.

MRN номер или какой то свой референс, внутренний?

свой внутренний. Я думаю, МРН там тоже где-то есть указан в документе. По логике вещей. Но я лично никогда не задумывался над тем, как они номер формируют.

в квитанции об оплате наличными прямо на таможне.

это фирма будет платить наличными на таможне? вы уверены?

конечно уверен. не знал бы- не говорил бы. Сам платил и знаю что другие платили. Четырехзначные суммы, вполне нормально, пож квитанцию.