Добрый день. Пригласили человека в Германию. Прилетел сюда, напрямую в Германию.
Назад хочет через Италию ехать, то есть туда на несколько дней, и обратно в СНГ. Это же нормальный вариант? Ничего не скажут, что сразу не полетел из Германии напрямую назад?

Лишь бы срок визы до отлёта не истёк.
Может и спросят. А он ответит: захотелось ещё и Италию посмотреть. Всё, инцидент исчерпан.
Вот наоборот - по немецкой визе сперва в Италию - тут уже отбрехиваться будет сложнее. Например, сказать можно, что было дешёвое предложение билета через Италию, потому решил сначаоа её глянуть - а основная цель поездки по-прежнему Германия.

ну, как я уже писал, прилетел он сюда
а вот хочется еще навестить в Италии родственников, у которых никогда не был, и потом сразу домой, чтобы не через нас

посмотрите какая буква в визе стоит. есть буквы с которыми можно путешествовать,а есть в конкретную страну .если буква не та будет -будут проблемы в будущем .