В принципе правильно некоторые источники заявляют. Визу выдает та страна Шенгена, в которой находится основная цель поездки. Поэтому будьте готовы обосновать цель поездки и обьяснить, зачем поехали через Германию. Я не знаю, насколько серьезные проблемы, но цепляться будут. Зачем это Вам?

Как правило, виза действительна для всей шенгенской территории и, тем не менее, не дает желаемой свободы передвижения. При подаче заявления на визу необходимо указать цель поездки. Отклонение от цели поездки разрешены только при наличии уважительных причин.
Не уверен в правильности заявлений этих источников, так как каких-либо ограничений по стране въезда не существует. Как прабило, ограничения определяются лишь целью поездки. Возможно, данный слух был вызван фактами, когда разворачивали на границе людей с шенгенской визой Германии (т.е. цель поездки - туризм по Германии), пытавшихся въехать по ней в ту же Финляндию или наоборот с финской визой в Германию. Проблема в том, что пограничники могут самостоятельно принимать решения о разрешении въезда людям, навлекшим на себя подозрения в преднамеренном нарушении визового режима. Для подозрений достаточно наличия билетов в страну, которая не покрывается целью поездки.
Fang' nie an aufzuhören, hör' nie auf anzufangen!

Только не отклоняйтесь от цели пребывания и связанными с ней странами (напр. турпоездка Франция-Германия-Италия).
Fang' nie an aufzuhören, hör' nie auf anzufangen!

Сергей, у меня опять вопрос :).
Шенгенская гостевая виза выдаётся максимум на 3 месяца. При этом иностранец может находится на территории "шенгена" максимум 6 месяцев в году. Вопрос:
Имеет ли право иностранец после 3-х месяцев пробывания в Германии, а затем 3-х месяцев отсутсвия, опять получить гостевую визу на следующие 3 месяца (оформив документы зарание)? Имеет ли календарный год влияние на сроки пребывания или просто чередование: 3 месяца здесь, 3 там, опять 3 здесь, опять 3 там?
Зарание благодарю за ответ!

Имеет ли право иностранец после 3-х месяцев пробывания в Германии, а затем 3-х месяцев отсутсвия, опять получить гостевую визу на следующие 3 месяца (оформив документы зарание)?
Имеет. Только не понятно, что Вы имеете в виду под "оформив документы зарание".
Имеет ли календарный год влияние на сроки пребывания или просто чередование: 3 месяца здесь, 3 там, опять 3 здесь, опять 3 там?
Не имеет. Важно только, что в течение любого произвольно выбранного полугодового периода Вы пребываете в Германии не более 3х месяцев (например: месяц там - месяц здесь - месяц там - месяц здесь - ...).
не поймите меня правильно!