прочитала, что российское гражданство ребенку оформляется по заявлению.
по какому заявлению-то ? кто его просит?

Зависит от статьи, по которой приобретается гражданство:
по ст.12 - Прошу оформить наличие гражданства Российской Федерации по рождению
по ст.14 - Прошу принять в гражданство Российской Федерации в упрощенном порядке

пару лет назад русской матери просто ставили штамп в свидетельство о рождении. Сейчас новое что-то приняли?

И пару лет назад и сейчас надо писать заявление. Формулировка у них разная.
Штамп просто по предъявлению соответсвующих документов никто не ставит - без заявления никак.

даже если ребенок родился в России от двух русски родителей?

Естественно!
www.gosuslugi.ru/ru/card/index.php?coid_4=65&ccoid_4=71&poid_4=50&soid_4=...

в 2008 году приказ вышел?

Почему в 2008?
Закон о гражданстве вышел в 2002 году.
Вы приходите в гос.учреждение приносите СОР, паспорта родителей и говорите "поставьте штампик о гражданстве"?!
Вам скажут пишите заявление.
Если Вы подавали документы на гражданство ребенка, то где-то ставили свои подписи - в заявлении конечно.
ПыСы
Впрочем так же как и в Германии, Вы приходите - говорите, что Вам нужно, подаете документы и получаете антраг для заполнения.

Вы ошиблись ссылкой. правильная:
www.gosuslugi.ru/ru/card/index.php?coid_4=65&ccoid_4=71&poid_4=50&soid_4=...
из нее в частности видно, что для удостоверения наличия российского гражданства у ребенка (приобретенного по рождению) заявление вовсе не обязательно.

Я не ошиблась так letominus писала:

по ст. 12 делается Оформление приобретения гражданства Российской Федерации по рождению
А потом уже Удостоверение наличия у ребенка гражданства Российской Федерации
Одно вытекает из другого.

не вытекает. по крайней мере при удостоверении наличия на территоррии РФ (о котором мы сейчас говорим). настоятельно рекомендую ознакомиться с приказом Федеральной миграционной службы (ФМС России) от 19 марта 2008 г. N 64 ("Административный регламент исполнения Федеральной миграционной службой государственной функции по осуществлению полномочий в сфере реализации законодательства о гражданстве Российской Федерации"). в частности там Вы можете найти:
Удостоверение наличия у ребенка гражданства Российской Федерации (пункты "а", "б", "в" части первой статьи 12, части 2, 4 статьи 26 Федерального закона)
21. Данная функция исполняется по устной просьбе родителя (родителей) или законного представителя ребенка в возрасте до 14 лет, приобретшего гражданство Российской Федерации по рождению, в день обращения (пункт 45.3 Положения).
21.1. Исполнением функции (по желанию заявителя) является внесение в установленном порядке сведений о ребенке в паспорт гражданина Российской Федерации, удостоверяющего личность гражданина Российской Федерации на территории Российской Федерации, родителя (усыновителя), а также в паспорт гражданина Российской Федерации для выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию, проставление отметки в свидетельство о рождении ребенка.
21.2. Для исполнения государственной функции необходимо обращение заявителя в структурное подразделение территориального органа по месту жительства, месту жительства или рождения ребенка, месту нахождения ребенка в соответствующем учреждении, а при отсутствии места жительства - по месту фактического проживания заявителя (ребенка).
21.3. Заявитель представляет документы, удостоверяющие личность и гражданство обоих родителей (единственного родителя), и свидетельство о рождении ребенка. В случаях, предусмотренных пунктами "в" и "г" части первой статьи 12 Федерального закона, также должны быть представлены документы, указанные в подпункте 45.5 Положения. Наличие единственного родителя либо признание второго родителя безвестно отсутствующим или лицом, место нахождения которого неизвестно, подтверждается документами, указанными в подпункте 45.6 Положения.
никакого отдельного "оформления наличия гражданства" в данном случае (пункты "а", "б", "в" части первой статьи 12, части 2, 4 статьи 26 Федерального закона) не требуется.