Швы между плитками довольно глубокие и местами не ровные.
Стоит ли перед тем как намазать силикон, замазать швы раствором (фугэнмассэ)?

Не стоит, силикон заполнит.

А как его правильно размазывать? Я вот нашёл в интернете описание:
http://www.smremont.com/instruments_and_materials/index_tplid4_recid233.html
Там рекомендуется наклеить ленту по краям, чтобы получить ровный шов, нанести силикон, размазать шпателем а потом убрать ленту, побрызгать мыльным раствором и растереть пальцем. Что-то мне страшно потом ещё и пальцем растирать.

Тут показать надо, не расскажешь так, до тонкостей. С лентой -ерунда.

Ну в двух словах то можно :)

Швы в местах где фугу наносить будете, вытрете тряпочкой просто с водой, дайте просохнуть.
Купите такую штуку:
http://www.badreparatur.de/images/product/Cramer-40401-Fugi-de2.jpg
Приставьте уголок ко шву, представьте себе, что готовый силикон должен полность закрыть шов. Выбирете нужный радиус.
Наносите силикон (никаких полосок не надо), проведите медленно уголком. Припасите побольше бумаги или тряпок, о кот. будете чистить уголок от лишнего силикона, чистить почаще.
Я больше пальцем не разглаживала. Получилось очень даже хорошо. Если хотите разгладить - то не сразу, пару минут подождите.
Успеха!

А ну вот точно, такой инструмент нужен, а то у меня такой шпатель специальный для силикона, вроде пальца, и если ширина щели меняется, то шов тоже неровный выходит. Ещё мне посоветовали смочить шпатель в жидкость для мытья посуды.

Можно и обойтись палочкой от Магнума или Гиганта и им подобных, мороженое то поди употребляешь, или если и не сам, так в семье кто-нить. Или мыло или шампунь, всё што скользкое. Полагаю что и растительное масло также сгодится, не пробовал, мыльными всегда пользовался.

Почти правильно, набери в детское ведёко воды половину и плесни туда пару раз шпюшлем, что б мыльный раствор был на очупь, макни туда эту беду и снимай силикон, как наберёшь достаточно, в том же ведёрке и помой, силикон там плавать останется. ровный шов-это результат опыта.

Швы между плитками довольно глубокие и местами не ровные.

намазать силикон