У него оба родителя немцы и вообще в роду нет ненемцев (этнически). Но вот дедушка в свидетельстве о рождении папы написал «русский». дедушка тоже был репрессирован, как лицо немецкой национальности (в составе семьи правда)Папа себя в моем советском свидетельстве о рождении написал русским, как и везде собственно.

1) То, что в роду все немцы, следует только из Ваших слов. Официально в документах дедушка и папа выбрали национальность "русский".

2) Репрессии в составе немецкой семьи подвергались и ненемецкие члены этой семьи (муж/жена, не родные дети).

Получается, что если в роду все немцы, а ты себя пишешь русским, то значит всё окей.

Так понимаю, Вы говорите о своём дедушке. В каком году родился дедушка? В его СОР указана национальность его родителей? Если да, то какая? Вы наверняка знаете, какая национальность была указана в паспортах его родителей? А то вполне возможно, что в роду все немцы только этнически и на словах, а по документам он мог выбрать любую национальность, что и сделал.

Органы ЗАГС, принимая решение, не опираются на Вашу семейную историю, воспоминания и эмоции. Единственным основанием для них являются представленные документы.